К поражениям десны, обусловленным не налетом, относятся поражения, вызванные специфическими бактериальными инфекциями (стрептококковой инфекцией, туберкулезом, гонореей, сифилисом). Сюда также относятся поражения десен при грибковых или вирусных инфекциях. Также в эту группу входят проявления системных заболеваний (красный плоский лишай, пемфигоид) на деснах.

Вследствие аллергических реакций на стоматологические материалы (благородные металлы, ртуть. никель и акрил), на ингредиенты лекарств, зубных паст, растворов для полоскания и т.п., на вспомогательные вещества в напитках или жевательных резинках также могут возникать заболевания и изменения десен.

Травматические поражения десен чаще всего являются результатом слишком агрессивной техники чистки зубов: слишком частой чистки, чистки слишком жесткой щеткой и/или под сильным давлением.