W pierwszej fazie leczenia należy powstrzymać stan zapalny. Pierwszym krokiem jest uświadomienie pacjenta. Następnie należy usunąć płytkę nazębną, złogi oraz kamień nazębny.

W fazie drugiej trwa usuwanie przyczyn choroby. Zalicza się tu: dokładne usunięcie złogów z powierzchni korzeni zębów, także po odpreparowaniu dziąsła (dla zapewnienia lepszego dostępu); usunięcie ziarniny (tkanki zapalnej z bogatą siecią naczyń krwionośnych) z kieszonek w obrębie tkanek miękkich i kości; towarzysząca antybiotykoterapia przy agresywnym przebiegu choroby, śluzówkowo-dziąsłowe zabiegi chirurgiczne.

W fazie trzeciej na pierwszy plan wysuwa się utrzymywanie wyników leczenia. Ta terapia zachowawcza związana jest ze stałą opieką nad pacjentem przy zastosowaniu dodatkowych środków, jak np. wygładzenie wystających brzegów wypełnień.