La cistectomia è la completa asportazione chirurgica di una piccola cisti con successiva sutura della ferita. Dopo l’incisione della mucosa, la cisti viene completamente rimossa. Tale terapia chirurgica può anche prevedere una apicectomia. La mucosa sopra alla lesione ossea viene poi saldamente suturata. Eventuali residui di cisti rimasti possono portare alla comparsa di recidive.