Les kystes folliculaires ne se forment que sur les dents incluses. Leur revêtement épithélial provient des cellules du sac dentaire que l’on appelle follicule. Les kystes résiduels ou kystes restants sont également des kystes odontogènes (qui se forment généralement à partir de kystes radiculaires ou folliculaires). Ils continuent souvent à se développer sans qu’on les remarque après l’avulsion des dents concernées dans l’os maxillaire.

Outre les kystes odontogènes, on distingue également les kystes des parties molles qui apparaissent surtout dans la muqueuse labiale ou de la joue. La mucocèle est un kyste de rétention salivaire ou mucoïde avec obstruction d’un canal excréteur entraînant une accumulation des sécrétions.