La quistostomía como método de tratamiento para quistes de gran tamaño permite cuidar las raíces y los nervios limítrofes. La mucosa y el hueso son abiertos por encima del quiste. A lo largo de la abertura en el hueso se corta una ventana en el quiste, el llamado saco quístico queda en el hueso. Mediante un destamponado dicha cavidad permanece abierta, convirtiéndose en una cavidad secundaria de la cavidad bucal. Dado que con la abertura el quiste pierde cualquier posibilidad de crecimiento, dicha cavidad ósea va reduciéndose progresivamente con el paso del tiempo.