Los quistes foliculares sólo se forman en dientes desplazados. Su revestimiento epitelial procede de células del saco dental, llamado folículo. Los quistes residuales tienen asimismo un origen ondotógeno (principalmente a partir de quistes radiculares o foliculares). A menudo continúan creciendo en el hueso maxilar pasando inadvertidos tras la extracción de los dientes afectados.

Además de los quistes ondontógenos hay los quistes de las partes blandas, que principalmente aparecen en la mucosa del labio o de la mejilla. El mucoceles es un quiste por retención de saliva y/o quiste por retención de mucosa. El sellado de un conducto excretor provoca una acumulación de secreción.