Radikuläre Zysten bilden sich nur an devitalen Zähnen, die eine Entzündung an der Wurzelspitze haben. Die genaue Diagnose Zyste ist nur durch eine histologische Untersuchung möglich, da das Weichgewebe einer Parodontitis apicalis im Röntgenbild ein ähnliches Aussehen wie eine Zyste hat. Der Entstehung einer Zyste muss ein Absterben der Pulpa vorausgegangen sein. Bakterien besiedeln den Wurzelkanal und lösen an der Wurzelspitze eine Entzündung aus, eine Parodontitis apicalis. Aus dieser apikalen Entzündung entwickelt sich eine radikuläre Zyste, die meistens schmerzlos ist. Der dabei um die Wurzelspitze herum entstandene Hohlraum ist mit einer trüben Flüssigkeit gefüllt.